Preview

Овощи России

Расширенный поиск

КЛАССИФИКАЦИЯ ОТЕЧЕСТВЕННЫХ СОРТОВ КАПУСТЫ BRASSICA OLERACEA L. C ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ SSR МАРКЕРОВ

https://doi.org/10.18619/2072-9146-2018-5-9-12

Полный текст:

Аннотация

Для получения новых селекционных форм среди разнообразных представителей вида Brassica oleracea L. (CC, 2n = 18) необходимо знать генетическую основу используемого селекционного материала. Традиционные сорта и новые сорта, гибриды, появляющиеся в последнее время, составляют основные генетические ресурсы. Классификация коллекций с использованием ДНК маркеров позволяет выделить ценные генотипы и установить родословные селекционного материала, с тем, чтобы в дальнейшем получать новые формы с набором ценных признаков. Использование микросателлитных маркеров (SSR) в виде B. oleracea L. показало высокую эффективность по выявлению полиморфизма между разновидностями, между сортами и внутри сортов. В данной работе было взято 16 пар праймеров для амплификации микросателлитных локусов геномной ДНК 24 отечественных селекционных образцов капусты. Все оцененные локусы характеризовались высокой информативностью: 14 из 16 имели уровень PIC > 0,5. На основе полученных данных была построена дендрограмма на основе коэффициента Джаккарда. В результате оценку генетического разнообразия проводили по 91 полученной микросателлитной аллели, где уровень наблюдаемого полиморфизма составил 85,7%. Большой кластер кочанных капуст состоял из трех подкластеров: в первом – среднеспелые и скороспелые образцы капусты белокочанной, во втором – краснокочанная и савойская капуста, в третьем – позднеспелые и среднеспелые образцы капусты белокочанной. Максимальное генетическое расстояние в кластере кочанных капуст с генетической схожестью всего 44,7% было обнаружено между капустой белокочанной Слава 231 и капустой савойской Вертю 1340. Два сорта капусты краснокочанной: Гако 741 и Каменная головка были генетически сходны между собой на 71,1%. Hевысокая степень генетической схожести этих образцов подтверждается тем, что эти сорта принадлежат к разным сортотипам. Наиболее генетически близкими оказались сорта капусты белокочанной Зимовка 1474 и Подарок с генетической схожестью 86,5%. Информация о топологической дифференциации коллекции капусты, полученная в результате кластерного анализа, является основой для селекционного отбора генетически ценного материала с использованием ДНК (т.е. маркер вспомогательной селекции).

Об авторах

А. С. Домблидес
ФГБНУ «Федеральный центр овощеводства»
Россия

кандидат с.-х наук, зав. лабораторией генетики и цитологии

143072, Россия, Московская обл., Одинцовский р-н, п. ВНИИССОК, ул. Селекционная, д.14



Е. А. Домблидес
ФГБНУ «Федеральный центр овощеводства»
Россия

кандидат с.-х. наук, зав. лабораторией биотехнологии

143072, Россия, Московская обл., Одинцовский р-н, п. ВНИИССОК, ул. Селекционная, д.14



Л. Л. Бондарева
ФГБНУ «Федеральный центр овощеводства»
Россия

доктор с.-х. наук, зав. лабораторией селекции и семеноводства капустных культур

143072, Россия, Московская обл., Одинцовский р-н, п. ВНИИССОК, ул. Селекционная, д.14



В. Ф. Пивоваров
ФГБНУ «Федеральный центр овощеводства»
Россия

академик РАН, доктор с.-х. наук, заслуженный деятель науки РФ, лауреат Государственной премии и премии Правительства РФ, профессор

143072, Россия, Московская обл., Одинцовский р-н, п. ВНИИССОК, ул. Селекционная, д.14



Список литературы

1. Артемьева А.М., Клоке Э., Чесноков Ю.В. Анализ филогенетических связей вида Brassica oleracea L. (Капуста огородная) // Вестник ВОГиС. – 2009. – Т.13. – No4. – С.759-771.

2. Шаптуренко М.Н., Печковская Т.В., Вакула С.И., Якимович А.В., Забара Ю.М., Хотылева Л.В. Информативные EST-SSR-маркеры для типирования и внутривидовой дифференциации Brassica oleracea var. capitata L. // Вавиловский журнал генетики и селекции. – 2016. – Т.20. – No1. – С.51-56. 10.18699/VJ16.133.

3. Formisano G., Roig C., Esteras C., Ercolano M.R., Nuez F., Monforte A.J., Picoґ M.B. Genetic diversity of Spanish Cucurbita pepo landraces: an unexploited resource for summer squash breeding // Genet. Resour. Crop Evol. 2012. V. 59, N6. P.1169–1184.

4. Izzah N.K., Lee J., Perumal, S., Park J.Y., Ahn K., Fu D., Kim G-B., Nam Y-W., Yang T-J. Microsatellite-based analysis of genetic diversity in 91 commercial Brassica oleracea L. cultivars belonging to six varietal groups // Genetic Resources and Crop Evolution. 2013. V.60. 10.1007/s10722-013-9966-3.

5. Jaccard P. Nouvelle recherches sur la distribution florale // Bull. Soc. Vandoise Sci. Nat. 1908. V.44, P.223-270.

6. Kumar A., Mishra P., Singh S.C., Sundaresan V. Efficiency of ISSR and RAPD markers in genetic divergence analysis and conservation management of Justicia adhatoda L., a medicinal plant // Plant Syst. Evol. – 2014. – V.300:1409-1420. 10.1007/s00606-013-0970-z.

7. Louarn S., Torp A.M., Holme I.B., Andersen S.B., Jensen B.D. Database derived microsatellite markers (SSRs) for cultivar differentiation in Brassica oleracea. // Genet. Resour. Crop. Evol. 2007. V.54, P.1717–1725.

8. Lowe, A.J., C. Moule, M. Trick, and K.J. Edwards. Efficient large-scale development of microsatellites for marker and mapping applications in Brassica crop species // Theor. Appl. Genet. 2004. V.108, P. 1103–1112.

9. Paterson A.H., Lan T-h, Amasino R., Osborn T.C. Quiros C Brassica genomics: a complement to, and early beneficiary of the Arabidopsis sequence. Genome Biology 2001. V.2, P.1011. 1011–1011.1014.

10. Powel W., Machray G.C., Povan J. Polymorphism revealed by simple sequence repeats // Trends Plant Sci. 1996. V.1, P.215–222.

11. Tonguc M., Griffiths P.D. Genetic relationships of Brassica vegetables determined using database derived sequence repeats // Euphytica 2004. V.137:193–201.


Для цитирования:


Домблидес А.С., Домблидес Е.А., Бондарева Л.Л., Пивоваров В.Ф. КЛАССИФИКАЦИЯ ОТЕЧЕСТВЕННЫХ СОРТОВ КАПУСТЫ BRASSICA OLERACEA L. C ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ SSR МАРКЕРОВ. Овощи России. 2018;(5):9-12. https://doi.org/10.18619/2072-9146-2018-5-9-12

For citation:


Domblides A.S., Domblides E.A., Bondareva L.L., Pivovarov V.F. CLASSIFICATION OF NATIONAL VARIETY ACCESSIONS OF CABBAGE BRASSICA OLERACEA L. WITH THE USE OF SSR MARKERS. Vegetable crops of Russia. 2018;(5):9-12. (In Russ.) https://doi.org/10.18619/2072-9146-2018-5-9-12

Просмотров: 65


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2072-9146 (Print)
ISSN 2618-7132 (Online)