PHYLOGENETIC AFFINITY OF ISOLATES OF CUCUMBER MOSAIC VIRUS (CMV) FROM CUCUMBER (CUCUMIS SATIVUS), PEPPER (CAPSICUM ANNUUM), AND AGERATUM (AGERATUM HOUSTONIANUM)
https://doi.org/10.18619/2072-9146-2016-1-87-91
Abstract
The nucleotide sequences of two strains of CMV isolated from cucumber and ageratum in the Primorsk region and one strain from pepper isolated in the North Korea have been studied. The phylogenetic linkages among isolated strains and strains of CMV from Genbank were revealed. The intragroup position of the isolated strains of CMV widespread in the Far East was specified.
About the Authors
R. V. Gnutova
Institute of Biology and Soil Science, FEB PAS
Russian Federation
Vladivostok, 690022, 100-letia Vladivostok, Pr.159
Russian Federation
Vladivostok, 690022, 100-letia Vladivostok, Pr.159
I. B. Nesmelov
Institute of Biology and Soil Science, FEB PAS
Russian Federation
Vladivostok, 690022, 100-letia Vladivostok, Pr.159
Russian Federation
Vladivostok, 690022, 100-letia Vladivostok, Pr.159
References
1. Гнутова Р.В. Таксономия вирусов растений Дальнего Востока России // Владивосток: Дальнаука, 2009. – 467 с.
2. Гнутова Р.В. Современное состояние изучения вирусов овощных культур на Дальнем Востоке // Известия ТСХА. – 2013. – Выпуск 5. – С. 32–49.
3. Гнутова Р.В., Толкач В.Ф., Несмелов И.Б. Идентификация, диагностика и филогенетический анализ вирусов овощных культур в агроценозах бассейна реки Амур (Хабаровский край) // Растительный мир Азиатской России, 2014. – №4(16). – С. 71–77.
4. Несмелов И.Б., Гнутова Р.В., Толкач В.Ф. Нуклеотидное разнообразие дальневосточных изолятов вируса огуречной мозаики // Матер. конф. «Регионы нового освоения: теоретические и практические вопросы изучения и сохранения биологического и ландшафтного разнообразия». Хабаровск. 15–18 октября. – 2012. – С. 115–118.
5. Толкач В.Ф., Гнутова Р.В. Вирус огуречной мозаики, выявленный на овощных культурах в Хабаровском крае // Сибирский вестник сельскохозяйственной науки. – 2008. – № 10. – С. 29–37.
6. Толкач В.Ф., Гнутова Р.В. Восточно-азиатские изоляты вируса огуречной мозаики на декоративных растениях в Приморье // Вестник защиты раст. 2011.– № 3. – С. 45–52.
7. Толкач В. Ф., Гнутова Р.В. Вредоносность вируса огуречной мозаики для овощных и декоративных культур // Защита растений и карантин. 2011. – № 7. – С. 24–26.
8. Толкач В. Ф., Гнутова Р.В. Поражение вирусом огуречной мозаики травянистых декоративных растений в Приморском крае // Бюлл. ГБС (в печати).
9. Чернявская Н.М., Гнутова Р.В., Толкач В.Ф. Физические особенности дальневосточных изолятов вируса огуречной мозаики, поражающих овощные культуры // Сельскохозяйственная биология. – 2002. – №3. – С.109–113.
10. Шафрановская И.В., Козловская З.Н., Толкач В.Ф., Гнутова Р.В. Биологические и антигенные свойства дальневосточного изолята вируса огуречной мозаики, выявленного из перца // В кн.: Фитовирусы Дальнего Востока. (Труды БПИ). – 167 с. Владивосток: Дальнаука. 1993. – C. 114–121.
11. Bekesiova I., Peter J., Mlynarova L. Isolation of high quality DNA and RNA from leaves // Plant Mol. Biol. Report. 1999. – Vol. 17.– P. 269–277.
12. Brunt A.A., Crabree K, Dallwitz M.J. Gibbs A.J., Watson L., Zurcher E. Plant Viruses Online. Description and List from the VIDE Database. 1997. – 1484 р.
13. Brunt A.A., Crabree K., Dallwitz M.J. Gibbs A.J., Watson L., Zurcher E. Cucumber mosaic cucumovirus // Plant Viruses Description and Lists from the VIDE Database. 1997. – P. 471–483.
14. Gnutova R.V., Sibiryakova I.I., Romanova S.A. Cucumber mosaic virus on peper and squash // Proceeding 8-th Internation Conference «Virus Diseased of Vegetables». – Prague-Ruzyne. Czech Republic. – July 9-15. – 1995. – C. 136–139.
15. Gnutova R.V., Nesmelov I.B., Vischnichenko V.K., Tolkach V.Fh. Phylogenetic analysis on 2b gene of cucumber mosaic cucumovirus // VI-th Intern. conf. «Bioresources and viruses». – Kуev. September 14–17. – 2010. – P. 204–205.
16. Palukaitis P., Garcia-Arenal F. Cucumoviruses // Adv. Virus Res. 2003. – Vol. 62. – P. 241–323.
17. Roossinck M. J. Evolutionary history of Cucumber Mosaic Virus deduced by phylogenetic analyses // J. Virol. 2002. Vol. 76. – №7. – P. 3382–3387.
18. Tamura K., Peterson D., Peterson N., Stecher G., Nei M., Kumar S. MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis using Maximum Likelihood, Evolutionary Distance, and Maximum Parsimony Methods. // Mol. Biol. Evol. 2011. Vol. 28. – №. 10. – P. 2731–2739.
Review
For citations:
Gnutova R.V., Nesmelov I.B. PHYLOGENETIC AFFINITY OF ISOLATES OF CUCUMBER MOSAIC VIRUS (CMV) FROM CUCUMBER (CUCUMIS SATIVUS), PEPPER (CAPSICUM ANNUUM), AND AGERATUM (AGERATUM HOUSTONIANUM). Vegetable crops of Russia. 2016;(1):87-91. (In Russ.) https://doi.org/10.18619/2072-9146-2016-1-87-91
Views:
997
Email this article 