Дана Алексеевна Доморацкая аспирант кафедры биотехнологии; младший научный сотрудник лаборатории бактериологии и анализа
Dana A. Domoratskaya PhD student; Junior Researcher of Laboratory of Bacteriology and GMO analysis of Testing Laboratory Center
Ольга Юрьевна Словарева кандидат биол. наук, доцент кафедры фитосанитарной биологии и безопасности экосистем, старший научный сотрудник начальник научно-методического отдела бактериологии
Olga Yu. Slovareva Cand. Sci. (Biology), Associate Professor of the Department of Phytosanitary Biology and Ecosystem Safety; Senior Researcher Head of the Scientific and Methodological Department of Bacteriology
Елена Анатольевна Калашникова доктор биол. наук, профессор, ведущий научный сотрудник
Elena A. Kalashnikova Dr. Sci. (Biology), Professor, Lead Researcher
Рима Нориковна Киракосян кандидат биол. наук, доцент кафедры биотехнологии
Rima N. Kirakosyan Cand. Sci. (Biology), Associate Professor of the Department of Biotechnology
Актуальность. Исследование посвящено разработке схемы выявления и идентификации бактерии Ralstonia solanacearum возбудителя бурой гнили картофеля, входящего в комплекс видов Ralstonia solanacearum ( R. solanacearum, R. pseudosolanacearum, R. syzygii ). Данный патоген поражает свыше 200 видов растений, включая экономически значимые культуры (картофель, томат, перец, баклажан), и включен в список карантинных организмов, отсутствующих на территории Российской Федерации. Цель работы: создание и апробация схемы лабораторной диагностики R. solanacearum для фитосанитарного контроля подкарантинной продукции.
Материал и методика. Методы, использованные в работе: метод подготовки проб (экстракция в фосфатно-солевом буфере с центрифугированием), ПЦР-анализ (ПЦР-РВ с использованием праймеров RS-I-F/RS-II-R/RS-P и коммерческого набора, ПЦР с детекцией результатов электрофорезом с праймерами RS-1-F/RS-1-R (RS-3-R)). Результаты. Была разработана оптимизированная схема по идентификации и выявлению возбудителя бурой гнили. Схема апробирована на 242 образцах подкарантинной продукции (картофель, розы, пионы, бананы), поступивших в диагностическую лабораторию в 2025 году. Результаты показали отсутствие бактерий комплекса R. solanacearum в образцах из Российской Федерации и выявили 14 случаев заражения клубней картофеля из импортных партий. При идентификации положительных образцов с помощью видоспецифичных праймеров RS-1-F/RS-1-R подтверждено присутствие R. solanacearum (sensu stricto).
Заключение. Ложноположительных и ложноотрицательных реакций в ходе апробации всех использованных тестов в рамках разработанной схемы зафиксировано не было, что свидетельствует об их 100% специфичности в рамках исследования. Итогом работы стало создание надежного алгоритма лабораторного исследования, обеспечивающего быструю и точную диагностику карантинного фитопатогена, что позволяет гарантировать фитосанитарную безопасность и соответствие продукции требованиям импортеров.
Relevance. The study is devoted to developing a scheme for the detection and identification of the bacterium Ralstonia solanacearum the causal agent of potato brown rot, which belongs to the Ralstonia solanacearum species complex ( R. solanacearum , R. pseudosolanacearum , R. syzygii ). This pathogen affects over 200 plant species, including economically important crops (potato, tomato, pepper, eggplant), and is listed as a quarantine organism absent from the territory of the Russian Federation. Objective: to create and test a laboratory diagnostic scheme for R. solanacearum for phytosanitary control of regulated products. Material and ". Methods used in the study: sample preparation method (extraction in phosphate-buffered saline with centrifugation), PCR analysis (real-time PCR using primers RS-IF/RS-II-R/RS-P and a commercial kit; PCR with electrophoretic detection using primers RS-1F/RS-1-R (RS-3-R)). Results. An optimized scheme for the identification and detection of the brown rot pathogen was developed. The scheme was tested on 242 samples of regulated products (potato, roses, peonies, bananas) submitted to the diagnostic laboratory in 2025. The results showed the absence of R. solanacearum complex bacteria in samples from the Russian Federation and revealed 14 cases of potato tuber infection in imported batches. Identification of positive samples using species-specific primers RS-1-F/RS-1-R confirmed the presence of R. solanacearum (sensu stricto).
Conclusion. No false-positive or false-negative reactions were recorded during the testing of all used assays within the framework of the developed scheme, indicating their 100% specificity within the study. The outcome of the work is the creation of a reliable laboratory testing algorithm that ensures rapid and accurate diagnosis of the quarantine phytopathogen, thereby guaranteeing phytosanitary safety and compliance of products with importer requirements. plant quarantine, phytopathogenic bacteria, molecular genetic identification methods, detection, identification
The authors declare that there are no conflicts of interest present.